AFF Cup 2016 nhiều khả năng Công Phượng vẫn phải chấp nhận ngồi ghế dự bị. Trong trận đấu giao hữu cuối cùng trước thềm giải vô địch Đông Nam Á ngày 12/11, gặp Avispa Fukuoka, chân sút sinh năm 1995 được HLV Hữu Thắng tung ra sân ngay từ đầu. Tuy nhiên, anh gây thất vọng khi bỏ lỡ một số cơ hội, trong đó có tình huống đối mặt với thủ môn đối phương.